kth.sePublications
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
3D ATPase Imaging for In Vivo Whole-Brain Mapping of ATPase and 31-P metabolites using Magnetization Transfer-MRSI
KTH, School of Engineering Sciences (SCI), Physics. KTH, School of Engineering Sciences (SCI), Applied Physics.
2025 (English)Independent thesis Advanced level (degree of Master (Two Years)), 20 credits / 30 HE creditsStudent thesisAlternative title
3D ATPase-avbildning för in vivo helhjärnsmappning av ATPase och 31-P-metaboliter med magnetiseringsöverförings-MRSI (Swedish)
Abstract [en]

Background: Phosphorus-31 Magnetization Transfer Magnetic ResonanceSpectroscopy Imaging (31P MT-MRSI) offers non-invasive insights intohuman brain metabolism, facilitating investigations into various pathologies.However, it typically suffers from low signal-to-noise ratio (SNR) andrequires long scan times due to the lower gyromagnetic ratio and metaboliteconcentrations compared to proton (1H) MRSI. Enhancing SNR requires highfields, advanced coils, optimized sequences, fast saturation schemes, andsophisticated reconstruction methods.Purpose: To develop and implement a methodology for imaging theadenosine triphosphatase (ATPase) forward reaction rate (𝑘𝑓 ,ATPase) and thekey phosphorus metabolites phosphocreatine (PCr), 𝛾-adenosine triphosphate(𝛾-ATP), and inorganic phosphate (Pi) in the human brain in vivo withinclinically feasible scan times.Methods: An optimized BISTRO sequence was employed for selectivesaturation of 𝛾-ATP. Data were acquired on a 7T MRI scanner using a 31∘hard excitation pulse, a PETALUTE trajectory with 361 petals yielding anominal resolution of 20 × 20 × 20 mm3, and a repetition time (TR) of 605 ms.Metabolite concentrations were quantified using LCModel, and the ATPaseforward reaction rate (𝑘𝑓 ,ATPase) was estimated using the T1nom method.Results: The BISTRO saturation scheme was successfully optimized throughsimulations and phantom experiments, achieving 98% 𝛾-ATP saturation in410 ms. In vivo, the phosphorus metabolites of interest were mapped in11 minutes, and the ATPase forward reaction rate (𝑘𝑓 ,ATPase) was determinedin 22 minutes, yielding a mean value of 0.22 s−1, consistent with literaturevalues.Conclusion: We successfully imaged three key phosphorus metabolites in11 minutes and mapped the ATPase forward reaction rate in 22 minutes,obtaining values consistent with previous studies. Further work is neededto enhance SNR and potentially reduce scan times for application in largercohorts to establish the method’s reproducibility and inter-subject variance.

Abstract [sv]

Bakgrund: Fosfor-31 magnetiseringsöverförings magnetresonansspektrosko-pisk avbildning (31P MT-MRSI) erbjuder icke-invasiva insikter i mänsklighjärnmetabolism och möjliggör undersökningar av olika patologier. Metodenlider dock typiskt av ett lågt signal-brusförhållande (SNR) och kräver långaskanningstider på grund av den lägre gyromagnetiska kvoten och lägremetabolitkoncentrationer jämfört med proton (1H) MRSI. För att förbättraSNR krävs höga fältstyrkor, avancerade spolar, optimerade sekvenser, snabbasaturationsscheman och sofistikerade rekonstruktionsmetoder.Syfte: Att utveckla och implementera en metodik för att avbilda adenos-intrifosfatas (ATPase) framåtreaktionshastighet (𝑘𝑓 ,ATPase) samt de centralafosformetaboliterna fosfokreatin (PCr), 𝛾-adenosintrifosfat (𝛾-ATP) ochoorganiskt fosfat (Pi) i mänsklig hjärna in vivo inom kliniskt rimligaskanningstider.Metoder: En optimerad BISTRO-sekvens användes för selektiv saturationav 𝛾-ATP. Data förvärvades med en 7T MR-kamera med en 31∘ hårdexcitationspuls, en PETALUTE-trajektoria med 361 petaler vilket gav ennominell upplösning på 20 × 20 × 20 mm3, och en repetitionstid (TR) på605 ms. Metabolitkoncentrationer kvantifierades med LCModel, och ATPaseframåtreaktionshastighet (𝑘𝑓 ,ATPase) uppskattades med T1nom-metoden.Resultat: BISTRO-saturationsschemat optimerades framgångsrikt genomsimuleringar och fantomexperiment, och uppnådde 98% 𝛾-ATP-saturation på410 ms. In vivo mappades de aktuella fosformetaboliterna på 11 minuter, ochATPase framåtreaktionshastighet (𝑘𝑓 ,ATPase) bestämdes på 22 minuter, vilketgav ett medelvärde på 0.22 s−1, överensstämmande med litteraturvärden.Slutsats: Vi har framgångsrikt avbildat tre centrala fosformetaboliter på 11minuter och mappat ATPase framåtreaktionshastighet på 22 minuter, ocherhållit värden som överensstämmer med tidigare studier. Ytterligare arbetekrävs för att förbättra SNR och potentiellt reducera skanningstiderna förtillämpning i större kohorter, samt för att fastställa metodens reproducerbarhetoch intersubjektvarians.

Place, publisher, year, edition, pages
2025.
Series
TRITA-SCI-GRU ; 2025:063
Keywords [en]
ATPase, X-Nuclei Imaging, MT-MRSI, Phosphorous Imaging, Metabolism, PETALTUTE, MRI
Keywords [sv]
ATPase, X-Kärnor bildavgivning, MT-MRSI, Bildavgivning av fosfor, Metabolism, PETALUTE, MRI
National Category
Physical Sciences
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kth:diva-364269OAI: oai:DiVA.org:kth-364269DiVA, id: diva2:1965627
Subject / course
Physics
Educational program
Master of Science - Engineering Physics
Examiners
Available from: 2025-06-09 Created: 2025-06-09 Last updated: 2025-06-09Bibliographically approved

Open Access in DiVA

fulltext(1446 kB)34 downloads
File information
File name FULLTEXT01.pdfFile size 1446 kBChecksum SHA-512
0d8c562f0c030e869fc9b202f887b2f6b13ac6e80340509e2cff647cfab990c1d52b87edd762436e5f1390523a9d820ed278e45ddfebe299f7c87686c74fc596
Type fulltextMimetype application/pdf

By organisation
PhysicsApplied Physics
Physical Sciences

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar
Total: 34 downloads
The number of downloads is the sum of all downloads of full texts. It may include eg previous versions that are now no longer available

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 152 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf