Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Shape-based regularization of electron tomographic reconstruction
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Matematik (Inst.). KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Centra, Strategiskt centrum för industriell och tillämpad matematik, CIAM.ORCID-id: 0000-0002-1118-6483
Visa övriga samt affilieringar
2012 (Engelska)Ingår i: IEEE Transactions on Medical Imaging, ISSN 0278-0062, E-ISSN 1558-254X, Vol. 31, nr 12, s. 2241-2252Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

We introduce a tomographic reconstruction method implemented using a shape-based regularization technique. Spatial models of known features in the structure being reconstructed are integrated into the reconstruction process as regularizers. Our regularization scheme is driven locally through shape information obtained from segmentation and compared with a known spatial model. We demonstrated our method on tomography data from digital phantoms, simulated data, and experimental electron tomography (ET) data of virus complexes. Our reconstruction showed reduced blurring and an improvement in the resolution of the reconstructed volume was also measured. This method also produced improved demarcation of spike boundaries in viral membranes when compared with popular techniques like weighted back projection and the algebraic reconstruction technique. Improved ET reconstructions will provide better structure elucidation and improved feature visualization, which can aid in solving key biological issues. Our method can also be generalized to other tomographic modalities.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2012. Vol. 31, nr 12, s. 2241-2252
Nyckelord [en]
Bayesian methods, electron microscopy, reconstruction, shape-based regularization, tomography
Nationell ämneskategori
Teknik och teknologier
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-111819DOI: 10.1109/TMI.2012.2214229ISI: 000313690600007Scopus ID: 2-s2.0-84870490769OAI: oai:DiVA.org:kth-111819DiVA, id: diva2:587791
Anmärkning

QC 20130115

Tillgänglig från: 2013-01-15 Skapad: 2013-01-14 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Personposter BETA

Öktem, Ozan

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Öktem, Ozan
Av organisationen
Matematik (Inst.)Strategiskt centrum för industriell och tillämpad matematik, CIAM
I samma tidskrift
IEEE Transactions on Medical Imaging
Teknik och teknologier

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 141 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf