kth.sePublikationer
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Secondary structure of protamine monitored by Raman optical activity
KTH, Skolan för kemivetenskap (CHE).
2014 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (masterexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)Alternativ titel
Studie av sekundärstruktur i protamin med Raman optisk aktivitet (ROA) (Svenska)
Abstract [en]

The project in question relates to reproductive proteins from Pieris Napi, a common Swedish butterfly species. The analysis was performed by capillary electrophoresis and mass spectroscopy, MALDI-TOF.

To ensure good results from the analysis of the fresh butterflies, a method development was performed on old butterfly samples. Several solvents were used to determine which extraction medium was best suited for protein extraction. MilliQ-water, acetonitrile, hexafluoroisopropanol and methanol were included in the examination. All solvents were well suited as extraction medium, except acetonitrile which lacked clear signals in the electropherograms.

When the method development was finished different types of proteins could be studied by the aid of the chosen extraction media. After electrophoresis on the fresh samples, it could be presured that both hydrophobic and hydrophilic proteins were present in the spermatophores. Multiple electropherograms with characteristic profiles for each solvent were obtained which indicated that different types of proteins were detected. Some similarities could be observed between the extraction from the MilliQ-water and methanol.

Protein stability during a three week period was assured by regular controls with electrophoresis. Stability could be shown through similar profiles in the electropherograms from the various weeks. Since the proteins shown such stability, MALDI-TOF analysis was done on the samples after all the electrophoresis was performed. Proteins were examined in both high and low molecular fields. This ensured results in the form of spectra. The spectrum obtained from HFIP-extraction differed from the spectrum from methanol- and water extractions, indicating that hydrophobic proteins are present in the spermatophores.

Abstract [sv]

Detta projekt behandlar en analys av reproduktionsproteiner från fjärilar av arten Pieris Napi. Analysen utfördes med hjälp av kapillärelektrofores och masspektroskopi, MALDI-TOF.

I början av den laborativa delen av projektet utfördes en metodbestämning på gamla fjärilar för att erhålla bra resultat från analyserna av de färska fjärilarna. Flera olika lösningsmedel provades som extraktionsmedel för att ta reda på vilka som var lämpliga att extrahera proteiner med. I undersökningen ingick MilliQ-vatten, acetonitril, hexafluoroisopropanol och metanol. Det visade sig att acetonitril inte lämpade sig som extraktionsmedel eftersom inga tydliga signaler upptäcktes i elektroferogrammen då detta användes. Resterande lösningsmedel fungerade väl att extrahera med.

När metodbestämningen var klar kunde olika typer av proteiner studeras med hjälp av de olika extraktionsmedlen som ansågs lämpliga. Efter elektrofores på de färska proverna kunde det antas att både hydrofoba och hydrofila proteiner fanns i spermatoforerna. Flera elektroferogram med karaktäristiska profiler för respektive lösningsmedel erhölls. Detta tyder på att olika typer av proteiner detekterats. Dock kunde vissa likheter iakttas mellan elektroferogrammen för MilliQ-vatten- och metanolextraktionerna.

Proteinernas stabilitet under en treveckorsperiod säkerställdes. Detta gjordes med hjälp av regelbundna kontroller på ett prov med hjälp av elektroforesanalys. Stabilitet kunde visas genom liknande profiler i elektroferogrammen från de olika veckorna. Eftersom proteinerna visade sig vara tillräckligt stabila så kunde även en MALDI-TOF analys på proverna göras efter att samtliga  elektroforesanalyser utförts. Proteiner undersöktes i både de högmolekylära och de lågmolekylära områdena. Detta gav resultat i form av spektra. Spektra från HFIP-exktraktioner skiljde sig åt från spektra från metanol- och vattenextraktionerna vilket visar att hydrofoba proteiner förekommer i spermatoforen.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. , s. 47
Nyckelord [en]
Protamine, flexible protein, secondary structure, PPII, ROA
Nationell ämneskategori
Teknik och teknologier
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-159737OAI: oai:DiVA.org:kth-159737DiVA, id: diva2:787188
Tillgänglig från: 2015-02-09 Skapad: 2015-02-09 Senast uppdaterad: 2022-06-23Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Av organisationen
Skolan för kemivetenskap (CHE)
Teknik och teknologier

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 266 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf