Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
An Averaged Polarizable Potential for Multiscale Modeling in Phospholipid Membranes
KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Teoretisk kemi och biologi.
Visa övriga samt affilieringar
2017 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Chemistry, ISSN 0192-8651, E-ISSN 1096-987X, Vol. 38, nr 9, s. 601-611Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

A set of average atom-centered charges and polarizabilities has been developed for three types of phospholipids for use in polarizable embedding calculations. The lipids investigated are 1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine, 1-palmitoyl-2oleoyl-sn-glycero-3-phosphocholine, and 1-palmitoyl-2-oleoylsn- glycerol-3-phospho-L-serine given their common use both in experimental and computational studies. The charges, and to a lesser extent the polarizabilities, are found to depend strongly on the molecular conformation of the lipids. Furthermore, the importance of explicit polarization is underlined for the description of larger assemblies of lipids, that is, membranes. In conclusion, we find that specially developed polarizable parameters are needed for embedding calculations in membranes, while common non-polarizable point-charge force fields usually perform well enough for structural and dynamical studies.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Wiley-VCH Verlagsgesellschaft, 2017. Vol. 38, nr 9, s. 601-611
Nyckelord [en]
multiscale modelling, polarizable embedding, QM/MM, lipid membrane, Prodan
Nationell ämneskategori
Teoretisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-205439DOI: 10.1002/jcc.24718ISI: 000394874800005PubMedID: 28160294Scopus ID: 2-s2.0-85013080834OAI: oai:DiVA.org:kth-205439DiVA, id: diva2:1097109
Anmärkning

QC 20170522

Tillgänglig från: 2017-05-22 Skapad: 2017-05-22 Senast uppdaterad: 2017-06-30Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Personposter BETA

Holmgaard List, Nanna

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Holmgaard List, NannaOlsen, Jogvan Magnus HaugaardPetersen, MichaelKongsted, Jacob
Av organisationen
Teoretisk kemi och biologi
I samma tidskrift
Journal of Computational Chemistry
Teoretisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 27 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf