Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
DiffractX: A Simulation Toolbox for Diffractive X-ray Optics
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biomedicinsk fysik och röntgenfysik.ORCID-id: 0000-0001-8604-735X
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biomedicinsk fysik och röntgenfysik.
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biomedicinsk fysik och röntgenfysik.
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biomedicinsk fysik och röntgenfysik.
Visa övriga samt affilieringar
2011 (Engelska)Ingår i: 10TH INTERNATIONAL CONFERENCE ON X-RAY MICROSCOPY / [ed] McNulty, I; Eyberger, C; Lai, B, American Institute of Physics (AIP), 2011, Vol. 1365, s. 341-344Konferensbidrag, Publicerat paper (Refereegranskat)
Abstract [en]

X-ray wavefront propagation is a powerful technique when simulating the performance of x-ray optical components. Using various numerical methods, interesting parameters such as focusing capability and efficiency can be investigated. Here we present the toolbox DiffractX, implemented in MATLAB. It contains many different wave propagation methods for the simulation of diffractive x-ray optics, including Fresnel propagation, the finite difference method (FDM), the thin object approximation, the rigorous coupled wave theory (RCWT), and the finite element method (FEM). All tools are accessed through a graphical interface, making the design of simulations fast and intuitive, even for users with little or no programming experience. The tools have been utilized to characterize realistic as well as idealized optical components. This will aid further developments of diffractive x-ray optics.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
American Institute of Physics (AIP), 2011. Vol. 1365, s. 341-344
Serie
AIP Conference Proceedings, ISSN 0094-243X ; 1365
Nyckelord [en]
wavefront-reconstruction imaging; X-ray diffraction; wave propagation; simulation
Nationell ämneskategori
Atom- och molekylfysik och optik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-73363DOI: 10.1063/1.3625374ISI: 000298672400081Scopus ID: 2-s2.0-80053310440OAI: oai:DiVA.org:kth-73363DiVA, id: diva2:488815
Konferens
10th International Conference on X-ray Microscopy. Univ Chicago, Chicago, IL. AUG 15-20, 2010
Anmärkning

QC 20120202

Tillgänglig från: 2012-02-02 Skapad: 2012-02-02 Senast uppdaterad: 2016-03-24Bibliografiskt granskad
Ingår i avhandling
1. 3D X-ray microscopy: image formation, tomography and instrumentation
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>3D X-ray microscopy: image formation, tomography and instrumentation
2016 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

Tomography in soft X-ray microscopy is an emerging technique for obtaining quantitative 3D structural information about cells. One of its strengths, compared with other techniques, is that it can image intact cells in their near-native state at a few 10 nm’s resolution, without staining. However, the methods for reconstructing 3D-data rely on algorithms that assume projection data, which the images are generally not due to the imaging systems’ limited depth of focus. To bring out the full potential of tomography in soft X-ray microscopy an improved understanding of the image formation is desired.

This Thesis reviews zone plate-based X-ray microscopy for biological imaging and the theory necessary for a numerical implementation of a 3D image formation model. Furthermore, a novel reconstruction approach is proposed that improves the overall resolution in a reconstruction of a tomographically imaged object. This is demonstrated by simulations and experiments. Finally, this Thesis covers work on the Stockholm X-ray microscope, including an upgrade of the X-ray source yielding unprecedented brightness for a compact system. With this upgrade it was possible to do high-quality imaging of cells in their near-native state with only 10 second exposures.

Abstract [sv]

Tomografi i mjukröntgenmikroskopi är en ny teknik för att få ut kvantitativ strukturell 3D information om celler. Dess styrka jämfört med andra tekniker är att den kan avbilda intakta celler i deras nära naturliga tillstånd med ett par 10 nm upplösning, utan omfattande preparering. Dock är metoderna för att rekonstruera 3D-data beroende av algoritmer som antar projektionsdata, vilket bilderna i allmänhet inte är på grund av avbildningsystemens begränsade skärpedjup. För att få ut den fulla potentialen av tomografi i röntgenmikroskopi behövs en ökad förståelse för avbildningsprocessen.

Denna avhandling behandlar zonplatte-baserad röntgenmikroskopi för biologisk avbildning och den nödvändiga teorin för en numerisk implementering av en avbildningsmodell i 3D. En ny rekonstruktionsmetod föreslås som förbättrar upplösningen i rekonstruktionen för ett tomografiskt avbildat objekt. Detta visas i simuleringar och experiment. Slutligen omfattar denna avhandling arbete på Stockholms mjukröntgenmikroskop, inklusive en uppgradering av röntgenkällan som ger oöverträffad ljusstyrka för ett kompakt system. Denna uppgradering möjliggör högkvalitativ avbildning av celler i deras nästan naturliga tillstånd med endast 10 sekunders exponering.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
Stockholm: KTH Royal Institute of Technology, 2016. s. viii, 75
Serie
TRITA-FYS, ISSN 0280-316X ; 2016:15
Nyckelord
X-ray microscopy, image formation theory, partial coherence in imaging, wave propagation, tomography, instrumentation
Nationell ämneskategori
Fysik
Forskningsämne
Fysik
Identifikatorer
urn:nbn:se:kth:diva-184095 (URN)978-91-7595-914-6 (ISBN)
Disputation
2016-04-22, FD5, Albanova universitetscentrum, Roslagstullsbacken 21, Stockholm, 13:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Forskningsfinansiär
VetenskapsrådetKnut och Alice Wallenbergs Stiftelse
Anmärkning

QC 20160324

Tillgänglig från: 2016-03-24 Skapad: 2016-03-23 Senast uppdaterad: 2016-03-24Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Personposter BETA

Selin, MårtenHertz, HansVogt, Ulrich

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Selin, MårtenBertilson, MichaelNilsson, Danielvon Hofsten, OlovHertz, HansVogt, Ulrich
Av organisationen
Biomedicinsk fysik och röntgenfysik
Atom- och molekylfysik och optik

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 175 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf