Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Scalability analysis of Dalton, a molecular structure program
KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), High Performance Computing and Visualization (HPCViz). KTH, Centra, SeRC - Swedish e-Science Research Centre.ORCID-id: 0000-0001-9693-6265
KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), High Performance Computing and Visualization (HPCViz). KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), Centra, Parallelldatorcentrum, PDC. KTH, Centra, SeRC - Swedish e-Science Research Centre.ORCID-id: 0000-0002-5415-1248
KTH, Skolan för bioteknologi (BIO), Teoretisk kemi och biologi. KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), Centra, Parallelldatorcentrum, PDC. KTH, Centra, SeRC - Swedish e-Science Research Centre.ORCID-id: 0000-0002-9123-8174
Visa övriga samt affilieringar
2013 (Engelska)Ingår i: Future generations computer systems, ISSN 0167-739X, E-ISSN 1872-7115, Vol. 29, nr 8, s. 2197-2204Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Dalton is a molecular electronic structure program featuring common methods of computational chemistry that are based on pure quantum mechanics (QM) as well as hybrid quantum mechanics/molecular mechanics (QM/MM). It is specialized and has a leading position in calculation of molecular properties with a large world-wide user community (over 2000 licenses issued). In this paper, we present a performance characterization and optimization of Dalton. We also propose a solution to avoid the master/worker design of Dalton to become a performance bottleneck for larger process numbers. With these improvements we obtain speedups of 4x, increasing the parallel efficiency of the code and being able to run in it in a much bigger number of cores.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2013. Vol. 29, nr 8, s. 2197-2204
Nyckelord [en]
Performance analysis, Optimization, Scalability
Nationell ämneskategori
Datorsystem
Forskningsämne
SRA - E-vetenskap (SeRC)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-136200DOI: 10.1016/j.future.2013.04.013ISI: 000326613400028Scopus ID: 2-s2.0-84886093468OAI: oai:DiVA.org:kth-136200DiVA, id: diva2:675573
Forskningsfinansiär
Swedish e‐Science Research Center
Anmärkning

QC 20131216

Tillgänglig från: 2013-12-04 Skapad: 2013-12-04 Senast uppdaterad: 2017-12-06Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Personposter BETA

Aguilar, XavierSchliephake, MichaelVahtras, OlavLaure, Erwin

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Aguilar, XavierSchliephake, MichaelVahtras, OlavLaure, Erwin
Av organisationen
High Performance Computing and Visualization (HPCViz)SeRC - Swedish e-Science Research CentreParallelldatorcentrum, PDCTeoretisk kemi och biologi
I samma tidskrift
Future generations computer systems
Datorsystem

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 998 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf