Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Gene-EnvironmentInteraction Analysis UsingGraphic Cards
KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), High Performance Computing and Visualization (HPCViz).
2015 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (masterexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)Alternativ titel
Analys av genmiljöinteraktion med använding avgrafikkort (Svenska)
Abstract [en]

Genome-wide association studies(GWAS) are used to find associations betweengenetic markers and diseases. One part of GWAS is to study interactions be-tween markers which can play an important role in the risk for the disease. Thesearch for interactions can be computationally intensive. The aim of this thesiswas to improve the performance of software used for gene-environment interac-tion by using parallel programming techniques on graphical processors. A studyof the new programs performance, speedup and efficiency was made using mul-tiple simulated datasets. The program shows significantly better performancecompared with the older program.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2015. , s. 119
Nyckelord [en]
HPC, high performance computing, CUDA, GPU, GWAS, gene-environment interaction, interaction
Nationell ämneskategori
Datavetenskap (datalogi)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-163215OAI: oai:DiVA.org:kth-163215DiVA, id: diva2:799271
Utbildningsprogram
Teknologie masterexamen - Maskininlärning
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2015-04-21 Skapad: 2015-03-30 Senast uppdaterad: 2018-01-11Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

fulltext(6121 kB)202 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 6121 kBChecksumma SHA-512
9f7eb5a988ef1d7361e796cb3384f0fe04493ff9149864c7de91f0fddd5e6924a56c3cab396573662a5611818d46940aeeed9defde219ddc0d45dada7b6722c0
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
High Performance Computing and Visualization (HPCViz)
Datavetenskap (datalogi)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 202 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 365 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • harvard1
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf