Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Scaling of the GROMACS 4.6 molecular dynamics code on SuperMUC
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Teoretisk fysik, Beräkningsbiofysik. KTH, Skolan för datavetenskap och kommunikation (CSC), Centra, Parallelldatorcentrum, PDC.
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Teoretisk fysik, Beräkningsbiofysik.ORCID-id: 0000-0002-7498-7763
2014 (Engelska)Ingår i: Advances in Parallel Computing, ISSN 0927-5452, E-ISSN 1879-808X, Vol. 25, s. 722-727Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Here we report on the performance of GROMACS 4.6 on the SuperMUC cluster at the Leibniz Rechenzentrum in Garching. We carried out benchmarks with three biomolecular systems consisting of eighty thousand to twelve million atoms in a strong scaling test each. The twelve million atom simulation system reached a performance of 49 nanoseconds per day on 32,768 cores.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2014. Vol. 25, s. 722-727
Nationell ämneskategori
Data- och informationsvetenskap
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-168112DOI: 10.3233/978-1-61499-381-0-722ISI: 000452120400072Scopus ID: 2-s2.0-84902247605OAI: oai:DiVA.org:kth-168112DiVA, id: diva2:817058
Anmärkning

QC 20150604

Tillgänglig från: 2015-06-04 Skapad: 2015-05-27 Senast uppdaterad: 2020-02-19Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextScopus

Personposter BETA

Hess, Berk

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Apostolov, RossenHess, Berk
Av organisationen
BeräkningsbiofysikParallelldatorcentrum, PDC
I samma tidskrift
Advances in Parallel Computing
Data- och informationsvetenskap

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
urn-nbn
Totalt: 270 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf