Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Performance enhancements for GROMACS nonbonded interactions on BlueGene.
Computational Proteomics Group, John Curtin School of Medical Research, Australian National University, Australia.ORCID-id: 0000-0001-6363-2521
2011 (Engelska)Ingår i: Journal of Computational Chemistry, ISSN 0192-8651, E-ISSN 1096-987X, Vol. 32, nr 9Artikel i tidskrift (Refereegranskat) Published
Abstract [en]

Several improvements to the previously optimized GROMACS BlueGene inner loops that evaluate nonbonded interactions in molecular dynamics simulations are presented. The new improvements yielded an 11% decrease in running time for both PME and other kinds of GROMACS simulations that use nonbonded table look-ups. Some other GROMACS simulations will show a small gain.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
John Wiley & Sons, 2011. Vol. 32, nr 9
Nationell ämneskategori
Teoretisk kemi
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-182274DOI: 10.1002/jcc.21766ISI: 000290531000027PubMedID: 21469156Scopus ID: 2-s2.0-79955473704OAI: oai:DiVA.org:kth-182274DiVA, id: diva2:904182
Anmärkning

QC 20160226

Tillgänglig från: 2016-02-18 Skapad: 2016-02-18 Senast uppdaterad: 2017-11-30Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Övriga länkar

Förlagets fulltextPubMedScopus

Personposter BETA

Abraham, Mark J

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Abraham, Mark J
I samma tidskrift
Journal of Computational Chemistry
Teoretisk kemi

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

doi
pubmed
urn-nbn

Altmetricpoäng

doi
pubmed
urn-nbn
Totalt: 458 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf