Open this publication in new window or tab >>2022 (English)Doctoral thesis, comprehensive summary (Other academic)
Abstract [en]
Cancer is a major health problem, with premature death for many patients, and with a high monetary cost to society. The disease is complex to treat due to the many different types, but also because the disease-causing cells, that needs to be removed, are very similar to the normal cells. Traditional chemotherapy and radiotherapy therefore have a narrow therapeutic window. Targeted cancer therapy aims to precisely deliver a drug to the tumor tissue by recognizing biomarkers that are only, or at least mostly, associated with the cancer cells. Drug conjugates and fusion-toxins are two types of targeted drugs. They both consist of a cancer-targeting protein, a linker and a cytotoxic payload. The efficacy of drug conjugates and fusion toxins are determined by their targeting accuracy and cytotoxic potency. Optimization of drug conjugates and fusion-toxins concerns selecting the best combination of the three components for the best efficacy.
In my studies I have worked with targeting the human epidermal growth factor receptor 2 and 3, HER2 and HER3, respectively. I have used affibody molecules: ZHER2 and ZHER3, and an albumin binding domainderived affinity protein targeting HER2, ADAPT6. For in vivo half-life extension, I have used an albumin binding domain, ABD. As payloads, I have used the cytotoxic drugs DM1, MMAE, and MMAF, as well as a truncated version of Pseudomonas exotoxin A, PE25.
In paper I, the goal was to investigate the architecture of the tumor targeting part of affibody-derived drug conjugates. Seven different affibody constructs with different number and position of the affibody and ABD-domains were designed and evaluated, in vitro and in vivo. They differed in their effect on cell proliferation, where particularly the constructs with two affibody domains increased the rate of proliferation for the SKOV-3 cell line with high expression of HER2. In vivo, the constructs with one affibody domain had a longer blood retention and lower hepatic uptake compared to the constructs with two affibody domains. Two constructs were selected for characterization as drug conjugates, one that promoted cell proliferation strongly, and one that had only a minor effect on cell proliferation. The conjugates were investigated as drugs for treatment of mice carrying HER2- overexpressing SKOV-3 tumors. The results showed that the affibody drug conjugate ZHER2-ABD-mcDM1 was the most efficient drug. ZHER2-ABD- mcDM1 suppressed tumor growth and extended the median survival time of the mice from 37 to 63 days.
In paper II, the goal was to investigate the properties of affibody or ADAPT- based fusion-toxins, targeting the HER2 receptor. The results showed that utilizing ZHER2 as targeting domain, to carry the toxic peptide PE25 to HER2 overexpressing cells, was better than using a dual-HER2 binder, consisting of ZHER2 and ADAPT6. Furthermore, the results showed that PE25based fusion toxins with high affinity to HER2 do not necessarily increase the cytotoxic effect beyond a certain point in affinity for the receptor.
In paper III, the first HER3-targeting affibody drug conjugate was produced and studied. It was designed using the optimal format from paper I, i.e. affibody-ABD-mcDM1. The results showed a drug conjugate with a potent cytotoxic effect on the pancreatic cancer cell line, BxPC3, with an IC50 value of 6 nM. In mice, injection of a radiolabeled version of ZHER3-ABD-mcDM1, showed uptake in implanted BxPC3 tumors peaking at 6.3 ± 0.4 %ID/g at 6 h post-injection. The general biodistribution showed uptake in liver, lung, salivary gland, stomach, and small intestine, organs known to express HER3 naturally. Collectively, the results show that ZHER3-ABD-mcDM1 is a highly potent and specific drug conjugate, that motivates further development, and possibly investigation of its functionality in experimental therapy of HER3 overexpressing tumors in mice, and later humans.
In paper IV, the goal was to investigate different cytotoxic drugs as part of an affibody-based drug conjugate targeting HER2. The optimal architecture from paper I, was employed also here, ZHER2-ABD-drug. The drugs tested were the tubulin polymerization inhibitors DM1, MMAE, and MMAF. ZHER2-ABD-mcMMAF had the most potent cytotoxic effect, with an IC50 value of 0.18 nM for SKBR3 cells with high HER2 expression. ZHER2-ABD- mcMMAE did not perform well in the cytotoxicity experiment. A better linker connecting the drug to the protein is probably required. ZHER2-ABD- mcMMAF was the best performing drug conjugate with the highest potency, and lowest uptake in liver; slightly outperforming ZHER2-ABD-mcDM1.
In conclusion, the four papers cover generation and optimization of drug conjugates and fusion-toxin based on affibody molecules and ADAPTs. In the papers, new variants with desirable properties were identified and characterized.
Abstract [sv]
Cancer är ett stort hälsoproblem, med för tidig död för många patienter och med en hög ekonomisk kostnad för samhället. Sjukdomen är komplex att behandla på grund av de många olika sorter som finns, men också för att de sjukdomsframkallande cellerna, som måste avlägsnas, är mycket lika de normala cellerna. Traditionell kemoterapi och strålbehandling har därför ett smalt terapeutiskt fönster. Riktad cancerterapi syftar till att på ett precist sätt leverera ett läkemedel till tumörvävnaden genom att känna igen biomarkörer som endast, eller åtminstone mestadels, är associerade med cancercellerna. Läkemedelskonjugat och fusionstoxiner är två typer av riktade läkemedel. De består båda av ett protein som målsöker tumören, en länk och en cytotoxisk last. Effektiviteten av läkemedelskonjugat och fusionstoxiner bestäms av deras tumörmålsökande förmåga och deras cytotoxicitet. Optimering av läkemedelskonjugat och fusionstoxiner handlar om att välja den bästa kombinationen av de tre komponenterna för att uppnå bästa effekt.
I mina studier har jag arbetat med inriktning på human epidermal growth factor receptor 2 och 3, HER2 respektive HER3. Jag har använt affibodymolekyler: ZHER2 och ZHER3, och en ADAPT riktat mot HER2, ADAPT6. För förlängning av halveringstiden in vivo har jag använt en albuminbindande domän, ABD. Som cytotoxisk last har jag använt cellgifterna DM1, MMAE och MMAF, samt en trunkerad version av Pseudomonas exotoxin A, PE25.
I artikel I var målet att undersöka arkitekturen för den tumörmålsökande delen av affibodybaserade läkemedelskonjugat. Sju olika varianter med olika antal och position av affibodys och ABD domäner designades och utvärderades, in vitro och in vivo. De skilde sig i sin effekt på cellproliferationen, där särskilt varianterna med två affibodydomäner ökade proliferationshastigheten för SKOV-3-cellinjen, som har högt uttryck av HER2. In vivo hade varianterna med en affibodydomän en längre retention i blod och lägre leverupptag jämfört med varianterna med två affibodydomäner. Två varianter valdes ut för karakterisering som läkemedelskonjugat, en som främjade cellproliferation starkt och en som endast hade en mindre effekt på cellproliferation. Konjugaten undersöktes som läkemedel för behandling av möss som bar HER2-överuttryckande SKOV-3-tumörer. Resultaten visade att affibody-läkemedelskonjugatet ZHER2-ABD-mcDM1 var det mest effektiva. ZHER2-ABD-mcDM1 undertryckte tumörtillväxt och förlängde medianöverlevnadstiden för mössen från 37 till 63 dagar.
I artikel II var målet att undersöka egenskaperna hos affibody eller ADAPT- baserade fusionstoxiner, riktade mot HER2-receptorn. Resultaten visade att användningen av ZHER2 som målsökande domän, för att bära den toxiska peptiden PE25 till HER2-överuttryckande celler, var bättre än att använda en dubbel-HER2-bindare, bestående av ZHER2 och ADAPT6. Dessutom visade resultaten att PE25-baserade fusionstoxiner med hög affinitet till HER2 inte nödvändigtvis ökar den cytotoxiska effekten när en viss affinitet för receptorn har uppnåtts.
I artikel III producerades och studerades det första HER3-riktade affibody- läkemedelskonjugatet. Den designades med det optimala formatet från artikel I, dvs affibody-ABD-mcDM1. Resultaten visade att läkemedelskonjugatet hade en potent cytotoxisk effekt på pankreas-cancer- cellinjen, BxPC3, med ett IC50-värde på 6 nM. Hos möss visade injektion av en radiomärkt version av ZHER3-ABD-mcDM1 upptag i implanterade BxPC3-tumörer med en topp på 6,3 ± 0,4 % ID/g, 6 timmar efter injektion. Den allmänna biodistributionen visade upptag i lever, lungor, spottkörtel, mage och tunntarm, organ som är kända för att naturligt uttrycka HER3. Sammantaget visar resultaten att ZHER3-ABD-mcDM1 är ett mycket potent och specifikt läkemedelskonjugat, som motiverar vidareutveckling, och möjligen undersökning av dess funktionalitet i experimentell terapi av HER3-överuttryckande tumörer hos möss och senare människor.
I artikel IV var målet att undersöka olika cellgifter som en del av ett affibody- baserat läkemedelskonjugat riktat mot HER2. Den optimala arkitekturen från artikel I användes också här: ZHER2-ABD-last. De cytotoxiska laster som undersöktes var tubulin-polymerisations-hämmarna DM1, MMAE och MMAF. ZHER2-ABD-mcMMAF hade den mest potenta cytotoxiska effekten, med ett IC50-värde på 0,18 nM för SKBR3-celler med högt HER2-uttryck. ZHER2-ABD-mcMMAE fungerade inte så bra i cytotoxicitets-experimentet. En bättre länk som kopplar lasten till proteinet krävs förmodligen. ZHER2- ABD-mcMMAF var det bästa läkemedelskonjugatet med högst potens och lägsta upptaget i levern. Den var något bättre än ZHER2-ABD-mcDM1.
Sammanfattningsvis täcker de fyra artiklarna generering och optimering av läkemedelskonjugat och fusionstoxiner baserade på affibodymolekyler och en ADAPT. I artiklarna identifierades och karakteriserades nya varianter med önskvärda egenskaper.
Place, publisher, year, edition, pages
KTH Royal Institute of Technology, 2022. p. xiii, 102
Series
TRITA-CBH-FOU ; 2022:13
Keywords
HER2, Affibody, Cancer, ADAPT, Protein engineering, PE38, DM1, MMAE, MMAF
National Category
Biochemistry Molecular Biology
Research subject
Biotechnology
Identifiers
urn:nbn:se:kth:diva-308526 (URN)978-91-8040-146-3 (ISBN)
Public defence
2022-03-11, Oskar Kleins Auditorium, Hannes Alfvéns Väg 11, Albanova University Center, Stockholm, 10:15 (English)
Opponent
Supervisors
Note
QC 20220316
2022-02-112022-02-092025-02-20Bibliographically approved