kth.sePublikationer KTH
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Quantitative and functional assessment of Arc n-meric states in membrane interaction and AMPA receptor endocytosis
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biofysik. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. (Ilaria Testa)ORCID-id: 0000-0002-4209-5381
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biofysik. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. (Ilaria Testa)ORCID-id: 0000-0001-9391-1476
KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biofysik. (Ilaria Testa)ORCID-id: 0000-0003-0972-0816
KTH, Skolan för teknikvetenskap (SCI), Tillämpad fysik, Biofysik. KTH, Centra, Science for Life Laboratory, SciLifeLab. (Ilaria Testa)ORCID-id: 0000-0002-3554-9322
Visa övriga samt affilieringar
(Engelska)Manuskript (preprint) (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

Arc (or Arg3.1), Activity Regulated-Cytoskeleton associated-protein is pivotal to mediate plastic responses in neuronal cells. In vitro and in vivo studies suggest its ability to form high- and low-order oligomers which are potentially involved in neuronal trafficking. Despite its important function, no direct observation of Arc oligomers in cells has been presented due to its highly regulated spatiotemporal expression, the small size of the structures, the lack of appropriate labelling strategies and the background associated to free diffusing cytosolic proteins. Here, we take advantage of several complementary advanced fluorescence microscopy and spectroscopy techniques to observe and quantify Arc oligomeric states in cellular environment especially in the synapses. In cells, we uncovered Arc-Arc intermolecular interactions, Arc tendency to form liquid condensates and to interact with lipid bilayers. High-order oligomers are found to localize at the excitatory synaptic compartment and to directly affects AMPA receptor surface levels. Together, our observations support the model by which Arc oligomerization mediates plasma- membrane negative inward curvature favoring AMPA receptors endocytosis.

Nyckelord [en]
Arc (Activity-regulated cytoskeleton-associated protein), AMPA receptors, oligomerization, STED, FCS, DNA-PAINT, STARSS, molecular dynamics simulations.
Nationell ämneskategori
Biologiska vetenskaper
Forskningsämne
Fysik, Biologisk och biomedicinsk fysik
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-339641OAI: oai:DiVA.org:kth-339641DiVA, id: diva2:1812324
Anmärkning

QC 20231115

Tillgänglig från: 2023-11-15 Skapad: 2023-11-15 Senast uppdaterad: 2023-11-15Bibliografiskt granskad
Ingår i avhandling
1. Investigation of Neuronal Protein Trafficking at the Molecular Scale
Öppna denna publikation i ny flik eller fönster >>Investigation of Neuronal Protein Trafficking at the Molecular Scale
2023 (Engelska)Doktorsavhandling, sammanläggning (Övrigt vetenskapligt)
Abstract [en]

Neurons are polarized cells that encode information in the nervous system viaelectrochemical connections named synapses. The tuning of synapticconnections is enabled by a plastic protein trafficking system which operates atthe nanoscale to finely tweak the neuronal ultrastructure. Our understanding ofthe neuronal biology has certainly benefited from the advent of live-cellcompatible fluorescence techniques able to reach the molecular level. However,the neuronal trafficking system involves molecular complexes, from organelles tosynaptic modulators, which act with varying dynamics at differentspatiotemporal scales. A single technique struggles to portrait these complexphenomena since it is hard to combine molecular resolution, speed, and lowphototoxicity. Hence, their investigation often demands, together with technicaladvancements, the combination of advanced fluorescence methods withcomplementary features. In this thesis, I explore the neuronal protein traffickingsystem at the molecular scale applying cutting-edge fluorescence microscopy andspectroscopy techniques.The relationship between the geometry and dynamics of the tubular endoplasmicnetwork and the sub-compartment size of neurons is investigated using acombination of STED and parallelized RESOLFT microscopy. In addition, thethree-dimensional dynamic interaction between tubular endoplasmic reticulumand mitochondria is described.The basal activity-driven recycling of synaptic vesicles is, for the first time,monitored via event-triggered STED, an automated method able to initiate STEDimaging upon detection of events such as calcium spikes.Insights into the post-synaptic reorganization of scaffolding and skeletal proteinsupon stimulation is gained by extending the live-cell super-resolution throughputto all the dimensions with multi-foci and 3D parallelized RESOLFT.Lastly, the molecular states of Activity-Regulated Cytoskeleton-Associatedprotein (Arc) involved in distinct aspects of neuronal protein trafficking arestudied. Our observations, obtained combining distinct advanced methods asDNA-PAINT and STARSS, support a previously unexplored Arc mechanism ofaction.

Abstract [sv]

Neuroner är polariserade celler som kodar information i nervsystemet viaelektrokemiska kopplingar genom synapser. Inställningen av synaptiskaanslutningar möjliggörs av ett plastproteinhandelssystem som fungerar pånanoskala för att finjustera den neuronala ultrastrukturen. Vår förståelse av denneuronala biologin gynnades verkligen av tillkomsten av levande cell-kompatiblafluorescenstekniker som kan nå den molekylära nivån. Emellertid involverar detneuronala människohandelssystemet molekylära komplex, från organeller tillsynaptiska modulatorer, som verkar med distinkt dynamik på varierandespatiotemporala skalor. En enda teknik kämpar för att porträttera dessakomplexa fenomen eftersom det är svårt att kombinera molekylär upplösning,hastighet och mildhet. Därför kräver deras undersökning ofta, tillsammans medtekniska framsteg, kombinationen av fluorescensmetoder med komplementäraegenskaper. I avhandlingen utforskar jag det neuronala proteinhandelssystemeti molekylär skala med användning av distinkta banbrytandefluorescensmikroskopi och spektroskopitekniker. Den neuronala tubuläraendoplasmatiska nätverksgeometrin och dynamiken var relaterad tillunderavdelningens storlek genom att kombinera STED och parallelliseradRESOLFT-mikroskopi. Dessutom beskrevs den tredimensionella dynamiskainteraktionen mellan tubulärt endoplasmatiskt retikulum och mitokondrier.Den basalaktivitetsdrivna återvinningen av synaptiska vesiklar övervakades förförsta gången via händelseutlöst STED, en automatiserad metod som kan initieraSTED-avbildning vid upptäckt av händelser som kalciumspikar.Insikter i den postsynaptiska omorganiseringen av byggnadsställningar ochskelettproteiner vid stimulering erhölls och utökade genomströmningen avlevande cellers superupplösning till alla dimensioner med multifoci och 3DparallelliseradRESOLFT.Slutligen studerades de molekylära tillstånden av Activity-RegulatedCytoskeleton-Associated Protein (Arc), involverat i distinkta aspekter avneuronal proteinhandel. Våra observationer, erhållna genom att kombineradistinkta avancerade metoder som DNA-PAINT och STARSS, stödjer enbågpotential verkningsmekanism som tidigare outforskad.

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
KTH Royal Institute of Technology, 2023. s. 129
Serie
TRITA-SCI-FOU 2023:62
Nyckelord
Endoplasmic Reticulum, Mitochondria, Arc (Activity-regulated cytoskeleton-associated protein), oligomerization, pRESOLFT, STED, event-triggered FCS, DNA-PAINT, STARSS, molecular dynamics simulations
Nationell ämneskategori
Biofysik
Forskningsämne
Fysik, Biologisk och biomedicinsk fysik
Identifikatorer
urn:nbn:se:kth:diva-339643 (URN)978-91-8040-771-7 (ISBN)
Disputation
2023-12-15, Air&Fire, Tomtebodavägen 23,171 65, Solna, 09:00 (Engelska)
Opponent
Handledare
Anmärkning

QC 2023-11-17

Tillgänglig från: 2023-11-17 Skapad: 2023-11-15 Senast uppdaterad: 2025-02-20Bibliografiskt granskad

Open Access i DiVA

Fulltext saknas i DiVA

Person

Damenti, MartinaCoceano, GiovannaMendes Silva, MarilineAlvelid, JonatanSgattoni, ChiaraRems, LeaVolpato, AndreaDelemotte, LucieTesta, Ilaria

Sök vidare i DiVA

Av författaren/redaktören
Damenti, MartinaCoceano, GiovannaMendes Silva, MarilineAlvelid, JonatanSgattoni, ChiaraRems, LeaSezgin, ErdincVolpato, AndreaDelemotte, LucieMasullo, LucianoJungmann, RalfTesta, Ilaria
Av organisationen
BiofysikScience for Life Laboratory, SciLifeLab
Biologiska vetenskaper

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 362 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf