kth.sePublikationer KTH
Ändra sökning
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Exploring the Effect of Ventricular Volume on Cerebrospinal Fluid Protein Levels in Alzheimer’s Disease
KTH, Skolan för kemi, bioteknologi och hälsa (CBH), Proteinvetenskap.
2025 (Engelska)Självständigt arbete på avancerad nivå (masterexamen), 20 poäng / 30 hpStudentuppsats (Examensarbete)Alternativ titel
Effekten av ventrikelvolym på proteinnivåer i cerebrospinalvätska från patienter med Alzheimers sjukdom (Svenska)
Abstract [sv]

Alzheimers sjukdom (AD) kännetecknas av gradvis neurodegeneration, hjärnatrofi och förändrade nivåer av proteiner i cerebrospinalvätskan (CSF). Denna studie undersöker hur ventrikelförstoring, som är en strukturell indikator på hjärnatrofi, påverkar nivåerna av CSF-proteiner samt hur detta samband varierar mellan olika kliniska stadier av kognitiv nedsättning. 

Genom att kombinera ventrikelvolymer från magnetresonanstomografi (MRI) med CSF-proteinnivåer från en minnesklinikkohort, utvärderas om den tidigare föreslagna utspädningseffekten, där större ventrikelvolymer förknippas med lägre koncentrationer av CSF-proteiner, även kan observeras hos individer med AD. 

Linjär interaktionsmodellering visade att denna utspädningseffekt var tydligt närvarande hos personer med subjektiv kognitiv nedsättning (SCD), men avsevärt försvagad hos individer med AD. Denna reducerade effekt antyder att sjukdomsspecifika mekanismer kan störa det normala sambandet mellan ventrikelstorlek och proteinnivåer i CSF. 

Flera proteiner i CSF, däribland AQP4, AMPH, DDAH1, SNCB, GAP43 och ARPP21, uppvisade signifikant högre nivåer hos individer med AD jämfört med dem med SCD. Dessa förändringar speglar sannolikt centrala patologiska processer vid AD, såsom synaptisk degeneration, neuroinflammation, rubbad kväveoxidsignalering samt försämrad neuronal funktion och integritet. 

Klassificeringsmodeller med stödvektormaskiner (SVM) visade att en kombination av CSF-proteinnivåer och ventrikelvolymer gav bättre differentiering mellan AD och SCD jämfört med modeller baserade enbart på proteindata. Klassificeringsprestandan förbättrades ytterligare när modellerna inkluderade både ett tau-associerat och ett amyloid-associerat protein, i enlighet med tidigare fynd. 

Regressionsanalyser av kognitiv funktion visade att modeller som integrerade både CSF-markörer och ventrikelvolymer förklarade en större andel av variationen i kognition än modeller baserade enbart på CSF-data. 

Abstract [en]

Alzheimer’s disease (AD) is characterized by progressive neurodegeneration, brain atrophy, and altered cerebrospinal fluid (CSF) protein profiles. This study examines the effect of ventricular enlargement, a structural indicator of brain atrophy, on cerebrospinal fluid (CSF) protein levels. It investigates how this relationship may vary across different clinical stages of cognitive decline. By integrating MRI-based ventricular volume data with CSF proteomics in a memory clinic cohort, the study examines whether a previously reported dilution effect, where larger ventricular volumes correspond to lower CSF protein levels, is also present in AD patients. 

Linear interaction models revealed that the expected dilution effect was pronounced in individuals with subjective cognitive decline (SCD) but was notably attenuated in patients with AD. This attenuation suggests that disease-related processes may disrupt the typical volume-dependent dynamics of CSF protein levels. Several CSF proteins, including AQP4, AMPH, DDAH1, SNCB, GAP43, and ARPP21, were significantly elevated in AD compared to SCD, reflecting key pathological features of the disease, including synaptic degeneration, neuroinflammation, impaired nitric oxide signaling, and altered neuronal function or integrity. 

Support vector machine (SVM) classification models demonstrated that combining CSF protein levels with ventricular volume measures enhanced discrimination between AD and SCD compared to protein-only models. Classification performance was further enhanced when models included one tau-associated and one amyloid-associated protein, consistent with previous study findings. Regression analyses predicting cognitive outcomes demonstrated that models integrating both CSF protein markers and ventricular volume explained a greater proportion of variance than models using only CSF protein data.  

These results highlight the importance of jointly evaluating biochemical and structural brain features. Ventricular volume appears to be an essential modulator of CSF biomarker interpretation, and the integration of MRI and proteomic data supports the development of more accurate diagnostic and prognostic tools in AD. 

Ort, förlag, år, upplaga, sidor
2025.
Serie
TRITA-CBH-GRU ; 2025:148
Nyckelord [en]
Cerebrospinal Fluid (CSF), Alzheimer’s Disease (AD), Magnetic Resonance Imaging (MRI), Ventricular volume, Biomarkers
Nyckelord [sv]
Cerebrospinalvätska (CSF), Alzheimers sjukdom (AD), Magnetröntgen (MRI), Ventrikelvolym, Biomarkörer
Nationell ämneskategori
Medicinsk bioteknologi (Inriktn. mot cellbiologi (inkl. stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)
Identifikatorer
URN: urn:nbn:se:kth:diva-368090OAI: oai:DiVA.org:kth-368090DiVA, id: diva2:1986912
Ämne / kurs
Bioteknologi
Utbildningsprogram
Teknologie masterexamen - Medicinsk bioteknologi
Handledare
Examinatorer
Tillgänglig från: 2025-08-04 Skapad: 2025-08-04

Open Access i DiVA

fulltext(4393 kB)41 nedladdningar
Filinformation
Filnamn FULLTEXT01.pdfFilstorlek 4393 kBChecksumma SHA-512
b79737e127fc822b093a4e1619ebd10df51058b745f79aa097b21107fd0f23e83dfd825ee881cbb25be597b295f14076a2caa1d6be3cdb237f9218dccde56414
Typ fulltextMimetyp application/pdf

Av organisationen
Proteinvetenskap
Medicinsk bioteknologi (Inriktn. mot cellbiologi (inkl. stamcellsbiologi), molekylärbiologi, mikrobiologi, biokemi eller biofarmaci)

Sök vidare utanför DiVA

GoogleGoogle Scholar
Totalt: 41 nedladdningar
Antalet nedladdningar är summan av nedladdningar för alla fulltexter. Det kan inkludera t.ex tidigare versioner som nu inte längre är tillgängliga.

urn-nbn

Altmetricpoäng

urn-nbn
Totalt: 373 träffar
RefereraExporteraLänk till posten
Permanent länk

Direktlänk
Referera
Referensformat
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Annat format
Fler format
Språk
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Annat språk
Fler språk
Utmatningsformat
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf