kth.sePublications KTH
System disruptions
There are recurring service disruptions on some of the search portals due to high traffic. We are working to resolve the issue, you may temporarily encounter an error message.
Change search
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf
Automatization of Antithrombin III, Heparin Co-factor assay to STA R
KTH, School of Engineering Sciences in Chemistry, Biotechnology and Health (CBH), Protein Science.
2022 (English)Independent thesis Advanced level (degree of Master (Two Years)), 20 credits / 30 HE creditsStudent thesis
Abstract [sv]

År 1982 var Atenativ frisläppt på marknaden, produkten är ett läkemedel som idag produceras på Octapharma. Atenativ är ett koncentrat på proteinet antitrombin III, ett viktigt protein för upplösning av blodproppar i koaguleringskaskaden. Läkemedlet används främst för att behandla patienter med avsaknad av antitrombin, men har även andra användningsområden. Aktiviteten av produkten mäts idag genom en metod ”Antithrombin III, Heparin Co-factor assay”, där analysprincipen är baserad på European pharmacopeia. Den nuvarande manuella metoden är kinetisk och analyseras för han på en mikrotiterplatta, den är därför tidskrävande och slitsam för utföraren. Då analysmetoden är uppbyggd genom analys i platta leder detta till att metoden har en låg provkapacitet på bara 4 prover per analys. Nackdelarna med metoden skulle kunna lösas med hjälp av att automatisera metoden, vilket skulle kunna utföras av den fullt automatiska STA R instrumentet. För att kunna automatisera metoden krävs det att det linjära intervallet för kalibreringskurvan undersöks, detta gjordes genom att använda statistikprogrammet combistat, vilket innehöll den statistiska modellen slope ratio. Genom att använda slope ratio modellen kunde standarder och prover undersökas. I denna studie undersöktes två standarder, en plasma - och en koncentratbaserad standard. Plasma standarden gav ett högre R2 värde jämfört med koncentrat standarden men gav även en 20 % högre koncentration hos prover i jämförelse med provernas faktiska koncentration. Precisionen hos instrumentet testades genom att analysera 6 replikat av samma kontrollprov. Den relativa standardavvikelsen var 1.13, vilket är en god precision för instrumentet. Stabiliteten hos reagensen testades också genom att analysera 5 prover med 1 timmes mellanrum. Stabilitetsstudien visade att reagensen var stabil. 4 Atenativ prov analyserades på instrumentet och jämfördes med tidigare resultat från den manuella metoden. Den automatiserade metoden visade ett något lägre resultat jämfört med den manuella, däremot hade proverna för den manuella metoden analyserats direkt efter upplösning, medan proverna hade förvarats i en frys i 1 – 2 månader innan analys för den automatiska metoden. Den långa förvaringstiden kan ha lett till en minskning av aktivitet hos proverna. Studien visade att en automatisering av metoden är genomförbar och skulle leda till en metod som är mer tidseffektiv, mindre slitsam och kan analysera fler prover. 

Abstract [en]

In 1982, Atenativ was released to the market, a pharmaceutical today produced by Octapharma. The product is a concentrate of the protein Antithrombin III, an essential protein for dissolving blood clots in the coagulation pathway. The pharmaceutical is mainly used to treat patients with Antithrombin deficiency but are used for other purposes as well. The activity of the product is measured by an assay called “Antithrombin III, Heparin Co-factor assay” and is based on the assay principle described in the European pharmacopeia. The method is a kinetic method today performed by hand at Octapharma in a microtiter plate and is therefore strenuous and time-consuming for analysts. The method does also have a low capacity of only 4 samples and an automatization of the method would therefore be advantageous for the company. The automatized clotting instrument STA R would be an alternative for this automatization and is therefore tested in this report. In order to automate the method, a linear interval of the calibration curve would need to be tested. To find and evaluate the best fit, the pharmacopeia combistat statistical program were used. The program compared the sample with the calibration using the statistical evaluation model slope ratio and parallel line. Two calibrators were used, one plasma calibrator and one concentrate calibrator. The plasma standard gave a better R2 value compared to the concentrate standard but 20 % higher concentration of the samples compared to the real concentration and the concentrate standard. The precision of the instrument was tested by analyzing 6 samples and then looking at the relative standard deviation. The instrument did show a high precision of relative standard deviation of 1.13. The stability of the reagents was also evaluated by analyzing 5 samples, one hour after the other. The stability of the regents was approved. 4 Atenativ samples was analyzed by the instrument and compared with the results obtained from the manual method. The automated method did show a slightly lower concentration, this can be due to the samples used in the automated method were not directly dissolved, thus a loss of activity when being stored in the freezer for 1 – 2 months can occur. An automatization of the method is possible and would contribute to a less time-consuming, less strenuous and higher sample capacity method. This is needed to be future investigated. 

Place, publisher, year, edition, pages
2022.
Series
TRITA-CBH-GRU ; 2022:192
Keywords [en]
Antithrombin III, AT, Antithrombin deficiency, Atenativ, STA R, Automatization
National Category
Pharmaceutical and Medical Biotechnology
Identifiers
URN: urn:nbn:se:kth:diva-314518OAI: oai:DiVA.org:kth-314518DiVA, id: diva2:1673642
External cooperation
Octapharma
Subject / course
Biotechnology
Educational program
Master of Science - Medical Biotechnology
Supervisors
Examiners
Available from: 2022-06-21 Created: 2022-06-21 Last updated: 2025-02-17

Open Access in DiVA

No full text in DiVA

By organisation
Protein Science
Pharmaceutical and Medical Biotechnology

Search outside of DiVA

GoogleGoogle Scholar

urn-nbn

Altmetric score

urn-nbn
Total: 1106 hits
CiteExportLink to record
Permanent link

Direct link
Cite
Citation style
  • apa
  • ieee
  • modern-language-association-8th-edition
  • vancouver
  • Other style
More styles
Language
  • de-DE
  • en-GB
  • en-US
  • fi-FI
  • nn-NO
  • nn-NB
  • sv-SE
  • Other locale
More languages
Output format
  • html
  • text
  • asciidoc
  • rtf